Obsahem této bakalářské práce je testování vlivu konkrétního antibiotika na vybrané bakteriální kmeny. Cílem bylo určit nejnižší možné koncentrace antibiotika, kde je stále možné prokázat eradikaci biofilmu. Dalším cílem práce bylo zjistit minimální inhibiční koncentraci testovaného antibiotika.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis disserts upon testing of particular antibiotic influence on selected bacterial phyla. The main goal was to establish antibiotic's minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum biofilm eliminating concentration (MBEC) for selected bacterial biofilm.
biofilm, biofilm testing, biofilm rezistence, antibiotics, growth curve of bacteria
Rozsah průvodní práce
63
Jazyk
CZ
Anotace
Obsahem této bakalářské práce je testování vlivu konkrétního antibiotika na vybrané bakteriální kmeny. Cílem bylo určit nejnižší možné koncentrace antibiotika, kde je stále možné prokázat eradikaci biofilmu. Dalším cílem práce bylo zjistit minimální inhibiční koncentraci testovaného antibiotika.
Anotace v angličtině
This bachelor thesis disserts upon testing of particular antibiotic influence on selected bacterial phyla. The main goal was to establish antibiotic's minimum inhibitory concentration (MIC) and minimum biofilm eliminating concentration (MBEC) for selected bacterial biofilm.
biofilm, biofilm testing, biofilm rezistence, antibiotics, growth curve of bacteria
Zásady pro vypracování
Cíle práce:
Vypracování rešerše na dané téma: biofilmová rezistence na antibiotika. Výběr biofilm pozitivních bakteriálních kmenů a jejich kultivace. Výběr vhodného spektra antibiotik vzhledem k testovaným bakteriálním kmenům, zjištění MIC (minimální inhibiční koncentrace testovaného antibiotika) a MBEC (nejnižší koncentrace antibiotika, kde je ještě prokázána eradikace biofilmu). Testy budou prováděny modifikovanou Christensenovou zkumavkovou metodou.
Teoretická východiska (včetně výstupu z BP):
V laboratoři budou kultivovány a testovány vybrané biofilm-pozitivní mikrooragnismy. K jejich kultivačnímu médiu (BHI) budou přidávána vybraná antibiotika v různém ředění a bude zjišťována MIC a MBEC. Výběr testovaných mikroorganismů a antibiotik bude prováděn dle modelu reálných situací (konzultace v KNL - oddělení Klinická mikrobiologie a virologie). V rámci studia bude sledována růstová rychlost mikroorganismů, která dle literárních zdrojů v biofilmu ovlivňuje jeho citlivost na antibiotika.
Výzkumné otázky:
Hlavní výzkumnou otázkou práce: jaká je MIC a MBEC u konkrétních mikroorganismů a testovaných antibiotik. Jaký vliv má citlivost testovaných antibiotik na růstovou rychlost mikroorganismů. Dalším výstupem je přehled vhodných antibiotik na biofilm-pozitivní bakteriální kmeny.
Metoda:
Kvantitativní
Technika práce, vyhodnocení dat:
Jedná se o práci experimentální (laboratorní).
Práce v mikrobiologické laboratoři - vlastní testování, optimalizace metody, studium a testování MIC a MBEC.
Získané výsledky (data) budou zpracována pomocí grafických softwarů a výpočetních metod. Vizualizace bude prováděna pomocí optického mikroskopu. Dle dosažených výsledků bude provedeno vyhodnocení jednotlivých zadaných úkolů a výzkumných otázek.
Místo a čas realizace výzkumu:
Práce bude probíhat v laboratořích Ústavu zdravotnických studií TUL v měsících květen až listopad.
Vzorek:
Hodnoceným vzorkem budou vybrané bakteriální kmeny G+ a G- bakterií, dále spektrum antibiotik.
Zásady pro vypracování
Cíle práce:
Vypracování rešerše na dané téma: biofilmová rezistence na antibiotika. Výběr biofilm pozitivních bakteriálních kmenů a jejich kultivace. Výběr vhodného spektra antibiotik vzhledem k testovaným bakteriálním kmenům, zjištění MIC (minimální inhibiční koncentrace testovaného antibiotika) a MBEC (nejnižší koncentrace antibiotika, kde je ještě prokázána eradikace biofilmu). Testy budou prováděny modifikovanou Christensenovou zkumavkovou metodou.
Teoretická východiska (včetně výstupu z BP):
V laboratoři budou kultivovány a testovány vybrané biofilm-pozitivní mikrooragnismy. K jejich kultivačnímu médiu (BHI) budou přidávána vybraná antibiotika v různém ředění a bude zjišťována MIC a MBEC. Výběr testovaných mikroorganismů a antibiotik bude prováděn dle modelu reálných situací (konzultace v KNL - oddělení Klinická mikrobiologie a virologie). V rámci studia bude sledována růstová rychlost mikroorganismů, která dle literárních zdrojů v biofilmu ovlivňuje jeho citlivost na antibiotika.
Výzkumné otázky:
Hlavní výzkumnou otázkou práce: jaká je MIC a MBEC u konkrétních mikroorganismů a testovaných antibiotik. Jaký vliv má citlivost testovaných antibiotik na růstovou rychlost mikroorganismů. Dalším výstupem je přehled vhodných antibiotik na biofilm-pozitivní bakteriální kmeny.
Metoda:
Kvantitativní
Technika práce, vyhodnocení dat:
Jedná se o práci experimentální (laboratorní).
Práce v mikrobiologické laboratoři - vlastní testování, optimalizace metody, studium a testování MIC a MBEC.
Získané výsledky (data) budou zpracována pomocí grafických softwarů a výpočetních metod. Vizualizace bude prováděna pomocí optického mikroskopu. Dle dosažených výsledků bude provedeno vyhodnocení jednotlivých zadaných úkolů a výzkumných otázek.
Místo a čas realizace výzkumu:
Práce bude probíhat v laboratořích Ústavu zdravotnických studií TUL v měsících květen až listopad.
Vzorek:
Hodnoceným vzorkem budou vybrané bakteriální kmeny G+ a G- bakterií, dále spektrum antibiotik.
Seznam doporučené literatury
1. RULÍK, M. Mikrobiální biofilmy. Univerzita Palackého v Olomouci, 2011. ISBN 978-80-244-2747-8.
2. RŮŽIČKA, F., V. HOLÁ a M. VOTAVA. Možnosti průkazu tvorby biofilmu v rutinní mikrobiologické praxi. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie. 2006, 1(55), 2329. ISSN 1210-7913.
3. DJORDJEVIC, D., M. WIEDMANN a L. A. MCLANDSBOROUGH. Microtiter Plate Assay for Assessment of Listeria monocytogenes Biofilm Formation. Applied and Environmental Microbiology. 2002, 68(6), 2950 - 2958. ISSN 0099-2240.
4. SCHINDLER, J. Mikrobiologie: pro studenty zdravotnických oborů. Praha: Grada, 2010. ISBN 978-80-247-3170-4.
5. SCHINDLER, J. Mikrobiologie: pro studenty zdravotnických oborů. 2., dopl. a přeprac. vyd. Praha: Grada, 2014.
ISBN 978-80-247-4771-2.
6. BROWN, M. R. W., D. G. ALLISON a P. GILBERT. Resistance of bacterial biofilms to antibiotics a growth-rate related effect? Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 1988, 22(6), 777 - 780. ISSN 0305-7453.
7. MAH, T. C a G. A O'TOOLE. Mechanisms of biofilm resistance to antimicrobial agents.Trends in Microbiology. 2001, 9(1), 3439. ISSN 0966-842X.
8. STEWART, P. S. Mechanisms of antibiotic resistance in bacterial biofilms. International Journal of Medical Microbiology. 2002, 292(2), 107 - 113. ISSN 1438-4221.
9. STEWART, P. S. a J. W. COSTERTON. Antibiotic resistance of bacteria in biofilms. The Lancet. 2001, 358(9276), 135 - 138.
ISSN 0140-6736.
10. DOBROVOLNÁ, L. Biochemické aspekty užívání antibiotik [online]. Brno, 2010 [cit. 2016-03-28]. Dostupné
z:https://is.muni.cz/th/220879/pedf_b/Bakalarska_prace.pdf. Bakalářská práce. Vedoucí práce Mgr. Petr Ptáček, Ph.D.
Seznam doporučené literatury
1. RULÍK, M. Mikrobiální biofilmy. Univerzita Palackého v Olomouci, 2011. ISBN 978-80-244-2747-8.
2. RŮŽIČKA, F., V. HOLÁ a M. VOTAVA. Možnosti průkazu tvorby biofilmu v rutinní mikrobiologické praxi. Epidemiologie, mikrobiologie, imunologie. 2006, 1(55), 2329. ISSN 1210-7913.
3. DJORDJEVIC, D., M. WIEDMANN a L. A. MCLANDSBOROUGH. Microtiter Plate Assay for Assessment of Listeria monocytogenes Biofilm Formation. Applied and Environmental Microbiology. 2002, 68(6), 2950 - 2958. ISSN 0099-2240.
4. SCHINDLER, J. Mikrobiologie: pro studenty zdravotnických oborů. Praha: Grada, 2010. ISBN 978-80-247-3170-4.
5. SCHINDLER, J. Mikrobiologie: pro studenty zdravotnických oborů. 2., dopl. a přeprac. vyd. Praha: Grada, 2014.
ISBN 978-80-247-4771-2.
6. BROWN, M. R. W., D. G. ALLISON a P. GILBERT. Resistance of bacterial biofilms to antibiotics a growth-rate related effect? Journal of Antimicrobial Chemotherapy. 1988, 22(6), 777 - 780. ISSN 0305-7453.
7. MAH, T. C a G. A O'TOOLE. Mechanisms of biofilm resistance to antimicrobial agents.Trends in Microbiology. 2001, 9(1), 3439. ISSN 0966-842X.
8. STEWART, P. S. Mechanisms of antibiotic resistance in bacterial biofilms. International Journal of Medical Microbiology. 2002, 292(2), 107 - 113. ISSN 1438-4221.
9. STEWART, P. S. a J. W. COSTERTON. Antibiotic resistance of bacteria in biofilms. The Lancet. 2001, 358(9276), 135 - 138.
ISSN 0140-6736.
10. DOBROVOLNÁ, L. Biochemické aspekty užívání antibiotik [online]. Brno, 2010 [cit. 2016-03-28]. Dostupné
z:https://is.muni.cz/th/220879/pedf_b/Bakalarska_prace.pdf. Bakalářská práce. Vedoucí práce Mgr. Petr Ptáček, Ph.D.
Přílohy volně vložené
1 CD
Přílohy vázané v práci
ilustrace, grafy, schémata, tabulky
Převzato z knihovny
Ne
Plný text práce
Přílohy
Posudek(y) oponenta
Hodnocení vedoucího
Záznam průběhu obhajoby
Průběh obhajoby je zveřejněn pouze přihlášenému uživateli.